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PNA探針定制
PNA探針類型
無標記的PNA
-N端的游離胺
- N端的乙?;饔?/span>
帶標記的PNA
-N端和C端標記
-雙標記
修飾PNA
氨基酸修飾其他適當的官能團修飾
Alpha 或Gamma PNA
-多標記的PNA骨架
-PNA骨架的附加功能
設計指南
1. PNA有很好的親和力一般只需13~18個堿基即可。
2. 富含豐富的嘌呤堿基的序列有聚集現象且溶解度降低。
-嘌呤堿基含量限于80%(建議不要超過60%)
-嘌呤堿基伸展最好不要超過5個
3. 為增加溶解度可以在堿基序列中增加O linker (eg linker), E linker, X linker, 賴氨酸等溶解度促進因子。
4. PNA的N端標記時,為避免雜交時標記分子的影響在PNA和熒光標記中間添加O linker等。
5 . PNA的C端標記是,C端的末端加入賴氨酸或者L-半胱氨酸后加標記。
標記物種類
標記 | λads(nm) | λem(nm) | 標記 | λads(nm) | λem(nm) |
FAM,FITC | 492 | 518 | OregonGreen488 | 498 | 526 |
TAMRA | 553 | 576 | AlexaFluor488 | 494 | 517 |
TexasRed | 592 | 614 | AlexaFluor532 | 530 | 555 |
TO | 510 | 530 | Cy3 | 550 | 570 |
Dabcyl | 454 | - | Cy5 | 650 | 670 |
此外還有很多種類的熒光標記物,具體請咨詢。